RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568990.5

TSNAXIP1-215, Transcript of translin associated factor X interacting protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSNAXIP1, Length 2,517 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1-215ENST00000568990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.36■■■■□ 3.09
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.57■■■□□ 2.32
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.59■■■□□ 2.17
TSNAXIP1-215ENST00000568990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNAXIP1-215ENST00000568990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TSNAXIP1-215ENST00000568990 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.74■■■□□ 2.03
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ABCC9O60706 1549 aa27.66■■■□□ 2.02
TSNAXIP1-215ENST00000568990 NACADO15069 1562 aa27.44■■□□□ 1.98
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SCRIBQ14160 1630 aa27.43■■□□□ 1.98
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.07■■□□□ 1.92
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNAXIP1-215ENST00000568990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.67■■□□□ 1.86
TSNAXIP1-215ENST00000568990 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.64■■□□□ 1.86
TSNAXIP1-215ENST00000568990 MYT1Q01538 1121 aa26.64■■□□□ 1.85
TSNAXIP1-215ENST00000568990 WIZO95785 1651 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNAXIP1-215ENST00000568990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
TSNAXIP1-215ENST00000568990 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.39■■□□□ 1.82
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SMARCA4P51532 1647 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TRIM41Q8WV44 630 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNAXIP1-215ENST00000568990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSNAXIP1-215ENST00000568990 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SMARCA2P51531 1590 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.74■■□□□ 1.71
TSNAXIP1-215ENST00000568990 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ABCC8Q09428 1581 aa25.59■■□□□ 1.69
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TSNAXIP1-215ENST00000568990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TSNAXIP1-215ENST00000568990 NCAPD3P42695 1498 aa25.39■■□□□ 1.65
TSNAXIP1-215ENST00000568990 HMGXB3Q12766 1538 aa25.35■■□□□ 1.65
TSNAXIP1-215ENST00000568990 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.31■■□□□ 1.64
TSNAXIP1-215ENST00000568990 HRCP23327 699 aa25.3■■□□□ 1.64
TSNAXIP1-215ENST00000568990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.27■■□□□ 1.64
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SOGA1O94964 1423 aa25.24■■□□□ 1.63
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SYNJ1O43426 1573 aa25.2■■□□□ 1.62
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.16■■□□□ 1.62
TSNAXIP1-215ENST00000568990 EEA1Q15075 1411 aa25.11■■□□□ 1.61
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25■■□□□ 1.59
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CFTRP13569 1480 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TOP2BQ02880 1626 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNAXIP1-215ENST00000568990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.94■■□□□ 1.58
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.92■■□□□ 1.58
TSNAXIP1-215ENST00000568990 GOLGA3Q08378 1498 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CUX1P39880 1505 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CEP162Q5TB80 1403 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNAXIP1-215ENST00000568990 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PRDM2Q13029 1718 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNAXIP1-215ENST00000568990 KIF21BO75037 1637 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.79■■□□□ 1.56
TSNAXIP1-215ENST00000568990 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PRXQ9BXM0 1461 aa24.58■■□□□ 1.53
TSNAXIP1-215ENST00000568990 KIF27Q86VH2 1401 aa24.55■■□□□ 1.52
TSNAXIP1-215ENST00000568990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.53■■□□□ 1.52
TSNAXIP1-215ENST00000568990 BCL11AQ9H165 835 aa24.52■■□□□ 1.52
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.52■■□□□ 1.52
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CLIP1P30622 1438 aa24.51■■□□□ 1.51
TSNAXIP1-215ENST00000568990 NESP48681 1621 aa24.51■■□□□ 1.51
TSNAXIP1-215ENST00000568990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNAXIP1-215ENST00000568990 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CUX2O14529 1486 aa24.42■■□□□ 1.5
TSNAXIP1-215ENST00000568990 APLP2Q06481 763 aa24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 IGF1RP08069 1367 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TOPBP1Q92547 1522 aa24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1-215ENST00000568990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNAXIP1-215ENST00000568990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ARAP1Q96P48 1450 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.22■■□□□ 1.47
TSNAXIP1-215ENST00000568990 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.14■■□□□ 1.45
TSNAXIP1-215ENST00000568990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNAXIP1-215ENST00000568990 WDR97A6NE52 1622 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNAXIP1-215ENST00000568990 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CUL7Q14999 1698 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNAXIP1-215ENST00000568990 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNAXIP1-215ENST00000568990 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TSNAXIP1-215ENST00000568990 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TSNAXIP1-215ENST00000568990 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms