Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB18Q9NP72 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms