Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP62CLQ9H1M0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP62CLQ9H1M0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms