Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms