Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C2orf88Q9BSF0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf88Q9BSF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms