Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIKE1Q9BRV8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIKE1Q9BRV8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms