Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREX2Q9BQ50 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms