Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MMS19Q96T76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMS19Q96T76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMS19Q96T76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms