Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARXQ96QS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARXQ96QS3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms