Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DEPDC7Q96QD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEPDC7Q96QD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms