Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC138Q96M89 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC138Q96M89 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms