Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTUB1Q96FW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms