Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT43Q96FT9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT43Q96FT9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT43Q96FT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT43Q96FT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT43Q96FT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT43Q96FT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms