Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC4Q96FT7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC4Q96FT7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms