Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SGF29Q96ES7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SGF29Q96ES7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms