Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35B4Q969S0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35B4Q969S0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms