Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP7Q93009 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP7Q93009 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP7Q93009 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP7Q93009 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP7Q93009 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP7Q93009 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP7Q93009 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP7Q93009 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP7Q93009 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP7Q93009 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP7Q93009 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP7Q93009 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP7Q93009 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP7Q93009 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP7Q93009 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms