Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF3IP1Q8TDR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms