Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GADD45GIP1Q8TAE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1Q8TAE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1Q8TAE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms