Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIK3C3Q8NEB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PIK3C3Q8NEB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3C3Q8NEB9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms