Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L2Q8NAA4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG16L2Q8NAA4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms