Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC63Q8NA47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC63Q8NA47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms