Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNYL1Q8N7R7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNYL1Q8N7R7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms