Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC33Q8N5R6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC33Q8N5R6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC33Q8N5R6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms