Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNJLQ8IV13 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms