Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT12Q8IV01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT12Q8IV01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT12Q8IV01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms