Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX29P2Q8IUI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX29P2Q8IUI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX29P2Q8IUI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms