Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP34Q70CQ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP34Q70CQ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP34Q70CQ2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms