Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF493Q6ZR52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF493Q6ZR52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms