Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLPSL2Q6UWE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms