Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP40Q5TG30 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP40Q5TG30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP40Q5TG30 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms