Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATAD3BQ5T9A4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATAD3BQ5T9A4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms