Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPIN3Q5JUX0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIN3Q5JUX0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms