Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU2Q2VPK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTU2Q2VPK5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTU2Q2VPK5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms