Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIDA1Q1XH10 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIDA1Q1XH10 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKIDA1Q1XH10 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.9 ms