Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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