Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STX1AQ16623 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX1AQ16623 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX1AQ16623 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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