Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM1Q16610 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM1Q16610 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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