Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCBQ16585 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCBQ16585 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCBQ16585 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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