Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAPTM4AQ15012 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms