Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMCO1Q147U7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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