Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.228e-10■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 512.87□□□□□ -0.357e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.417e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.457e-7■■■□□ 16.8
PUM1Q14671 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.435e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.65e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.65e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.725e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 517.97■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 215.12■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-208ENST00000561059 947 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 310.26□□□□□ -0.772e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 524.44■■□□□ 1.52e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.22e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-218ENST00000569270 711 ntTSL 520.64■□□□□ 0.892e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 217.88■□□□□ 0.452e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-10■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 DNTTIP2-205ENST00000496535 691 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 ATG3-204ENST00000467275 559 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.933e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.478e-7■■■□□ 16.7
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PUM1Q14671 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.96e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 58.35□□□□□ -1.076e-7■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 515.4■□□□□ 0.061e-9■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-9■■■□□ 16.7
PUM1Q14671 FAM50A-204ENST00000478509 682 ntTSL 315.72■□□□□ 0.112e-12■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 FAM50A-205ENST00000481619 763 ntTSL 213.1□□□□□ -0.312e-12■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 FADS3-209ENST00000529525 530 ntTSL 327.11■■□□□ 1.933e-6■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-7■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 212.5□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.793e-7■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 CCDC174-205ENST00000476763 465 ntTSL 28.08□□□□□ -1.129e-7■■■□□ 16.6
PUM1Q14671 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.815e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 519.55■□□□□ 0.725e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.555e-7■■■□□ 16.5
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PUM1Q14671 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.915e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.945e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 27.63□□□□□ -1.195e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 SAFB-212ENST00000592396 620 ntTSL 46.25□□□□□ -1.415e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 QKI-204ENST00000361758 6085 ntTSL 522.27■■□□□ 1.162e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.552e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.115e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.075e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TIMM44-207ENST00000598675 744 ntTSL 314.74□□□□□ -0.055e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 514.36□□□□□ -0.115e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 SENP6-211ENST00000493959 867 ntTSL 323.71■■□□□ 1.391e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.18e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 IQGAP1-218ENST00000633485 5863 ntTSL 57.44□□□□□ -1.228e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.298e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.342e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 223.42■■□□□ 1.342e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.942e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 320.23■□□□□ 0.832e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.82e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.762e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.652e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 518.48■□□□□ 0.552e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 315.9■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-232ENST00000530445 1217 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 215.55■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 16.5
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