Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL3Q13618 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUL3Q13618 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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