Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PKD2Q13563 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PKD2Q13563 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PKD2Q13563 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PKD2Q13563 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD2Q13563 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
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