Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLEQ07864 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLEQ07864 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLEQ07864 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLEQ07864 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLEQ07864 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLEQ07864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLEQ07864 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLEQ07864 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLEQ07864 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms