Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNB3Q05901 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms