Protein–RNA interactions for Protein: Q04214

TY1B-MR1, Transposon Ty1-MR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR1Q04214 NMD4YLR363C 657 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 VTS1YOR359W 1572 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 BPL1YDL141W 2073 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 RRP3YHR065C 1506 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 MPM1YJL066C 759 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 RIA1YNL163C 3333 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 YJL107CYJL107C 1164 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 STE50YCL032W 1041 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 IMA2YOL157C 1770 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 RRP40YOL142W 723 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 ASK10YGR097W 3441 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 TUB3YML124C 1338 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 UBI4YLL039C 1146 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 NKP2YLR315W 462 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 RAT1YOR048C 3021 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 MTC5YDR128W 3447 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 CLB2YPR119W 1476 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 DBP8YHR169W 1296 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-MR1Q04214 SED4YCR067C 3198 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 AMA1YGR225W 1782 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YNL181WYNL181W 1224 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 CUE2YKL090W 1332 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 TMA17YDL110C 453 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 DPH6YLR143W 2058 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 ALG6YOR002W 1635 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YDR417CYDR417C 372 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 APC4YDR118W 1959 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YMR196WYMR196W 3267 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 CLP1YOR250C 1338 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YGL152CYGL152C 678 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YGR153WYGR153W 654 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 MRPL20YKR085C 588 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 IDP3YNL009W 1263 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 VHS1YDR247W 1386 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YPR071WYPR071W 636 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 TBF1YPL128C 1689 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 RAP1YNL216W 2484 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 YMR245WYMR245W 621 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 TLG2YOL018C 1194 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 RPL19AYBR084C-A 570 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 RTC5YOR118W 1704 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 RAD30YDR419W 1899 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 SSZ1YHR064C 1617 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 PTK2YJR059W 2457 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 MTF1YMR228W 1026 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1B-MR1Q04214 SLT2YHR030C 1455 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 CBF5YLR175W 1452 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 COP1YDL145C 3606 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 ATH1YPR026W 3636 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 SNA2YDR525W-A 240 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 YER145C-AYER145C-A 438 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 YNG1YOR064C 660 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 RGD1YBR260C 2001 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 BSC5YNR069C 1470 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 KRE28YDR532C 1158 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 ISY1YJR050W 708 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 SGE1YPR198W 1632 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 CAF4YKR036C 1932 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 RIO1YOR119C 1455 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 VCX1YDL128W 1236 nt7□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 BUD22YMR014W 1560 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 TYW3YGL050W 822 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 RER1YCL001W 567 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 LYP1YNL268W 1836 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 RFA1YAR007C 1866 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 RET1YOR207C 3450 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 KEX1YGL203C 2190 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 GDH2YDL215C 3279 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 API2YDR525W 330 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 NTE1YML059C 5040 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1B-MR1Q04214 ZPS1YOL154W 750 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 MTR10YOR160W 2919 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 YMR102CYMR102C 2505 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 CBK1YNL161W 2271 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 SUP35YDR172W 2058 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 LUC7YDL087C 786 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 AIM7YDR063W 450 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 PHM7YOL084W 2976 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 GAD1YMR250W 1758 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 RPL14AYKL006W 417 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 ROT2YBR229C 2865 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 RSC4YKR008W 1878 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 RRN9YMR270C 1098 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 RSC6YCR052W 1452 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 SYG1YIL047C 2709 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 MET31YPL038W 534 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 HXT14YNL318C 1623 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 VMA2YBR127C 1554 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 CTS2YDR371W 1536 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 BRE2YLR015W 1518 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 DCD1YHR144C 939 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 RIM101YHL027W 1878 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 MET12YPL023C 1974 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 FRA2YGL220W 363 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 MID2YLR332W 1131 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 DSC2YOL073C 969 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 ARB1YER036C 1833 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1B-MR1Q04214 YCR085WYCR085W 354 nt6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 102 ms