Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BNC1Q01954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms