Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA6Q01524 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA6Q01524 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms