Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEP78395 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEP78395 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms